By 17 er ødelagt, men Combine giver ikke op. Det samme gælder for Gordon Freeman.
Menneskeheden er spredt over hele verden, og alienstyrkerne fortsætter deres kamp for at få kontrol over jorden. Fysikeren Gordon Freeman og Alyx Vance arbejder på at aflytte en transmission fra Combine og blive genforenet med oprørsstyrkerne, inden menneskeheden er udryddet.
Som med tidligere dele af serien er Episode Twoen tænkende persons skydespil.Spillet er ikke kun fyldt med fysikbaserede gåder, men kampe kræver både opfindsomhed og hurtige reflekser.
—New York Times
Episode Two er ikke bare mere ambitiøs med dets leveldesign men også mere medrivende i dets plot. Det er præcist så givende, som det skal være at gennemføre spillet.
—Mac World
Baggrunden for dine tidligere eventyr er blot et ulmende ar på skylinen i Episode Two, og Citadelet ligner et for længst færdigt Jenga-spil. Episode Two føles vild, farlig og cool.
